Les 13 Eglises mennonites de Suisse comptent environ 2300 membres et font partie de la Conférence mennonite suisse anabaptiste (CMS). En Suisse, les mennonites sont officiellement reconnus en tant qu'Eglise libre. L'EMES collabore avec l'Alliance évangélique et participe aux travaux de la Communauté de travail des Eglises du Jura.