Cette proposition de réforme ne plaît pas à l'Eglise (orthodoxe) de Grèce, pays à 97 % orthodoxe. La controverse illustre la délicate situation des relations oecuméniques en Grèce. Antoni Koulouris, secrétaire général de l'Eglise réformée de Grèce, a rappelé que "cette clause obsolète a causé de sérieux problèmes, et devrait être supprimée. Notre Etat peut être libéral de certaines façons. Mais il y a toujours le danger qu'un représentant des autorités, constatant que vous n'êtes pas orthodoxe, réagisse à votre encontre et vous interroge sur votre nationalité." D'après lui, il existerait même des directives secrètes recommandant que les postes de haut niveau dans les institutions gouvernementales soient réservés aux orthodoxes. Les catholiques romains estiment aussi que toute référence à la religion engendre une certaine discrimination contre les Grecs non orthodoxes. En avril deux recrues catholiques de l'armée grecque avaient été averties qu'elles "ne pouvaient s'attendre à une promotion à cause de leur religion".